基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G440660 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:111632452-111635463 (-) |
| 描述 | Similar to At5g54890: CRS2-associated factor 2%2C mitochondrial (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030941 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g54890 |
可能参与线粒体中 IIB 组内含子的剪接。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g31010 |
可能参与线粒体中 IIB 组内含子的剪接。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0188000 |
可能参与线粒体中 IIB 组内含子的剪接。 | 暂无已核实直接文献 |
Os08g0174900 |
可能参与线粒体中 IIB 组内含子的剪接。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0323300 |
叶绿体中IIB类内含子剪接所必需。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000373 | Group II intron splicing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.571; 覆盖度=91.076; E 值=3.97e-169; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.571; 覆盖度=91.076; E 值=3.97e-169; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.613; 覆盖度=75.328; E 值=1.67e-103; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032981 | mitochondrial respiratory chain complex I assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.613; 覆盖度=75.328; E 值=1.67e-103; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033617 | mitochondrial respiratory chain complex IV assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.613; 覆盖度=75.328; E 值=1.67e-103; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.571; 覆盖度=91.076; E 值=3.97e-169; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.45; 覆盖度=82.152; E 值=7.53e-83; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.571; 覆盖度=91.076; E 值=3.97e-169; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.571; 覆盖度=91.076; E 值=3.97e-169; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G31010 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.613; 覆盖度=75.328; E 值=1.67e-103 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G54890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.571; 覆盖度=91.076; E 值=3.97e-169 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0174900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.56; 覆盖度=76.903; E 值=1.46e-101 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0188000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.632; 覆盖度=74.803; E 值=5.1e-156 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:542682 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.45; 覆盖度=82.152; E 值=7.53e-83 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |