基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G410540 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:103670631-103677245 (+) |
| 描述 | Similar to TGH: G patch domain-containing protein TGH (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_030546 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g23080 |
作为微小RNA (miRNA) 和小干扰RNA (siRNA) 生物合成的一个组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0489200 |
作为微小RNA (miRNA) 和小干扰RNA (siRNA) 生物合成的一个组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: B8B2G4 |
作为微小RNA (miRNA) 和小干扰RNA (siRNA) 生物合成的一个组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000398 | mRNA splicing, via spliceosome | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.967; 覆盖度=77.933; E 值=1.1e-37; UniProt GO evidence=IC:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006396 | RNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010087 | phloem or xylem histogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030422 | siRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031047 | regulatory ncRNA-mediated gene silencing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.888; 覆盖度=106.028; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035196 | miRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005654 | nucleoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.967; 覆盖度=77.933; E 值=1.1e-37; UniProt GO evidence=TAS:Reactome | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016607 | nuclear speck | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071013 | catalytic step 2 spliceosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.967; 覆盖度=77.933; E 值=1.1e-37; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070878 | primary miRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070883 | pre-miRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G23080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.535; 覆盖度=97.309; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bta:518738 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.012; 覆盖度=78.902; E 值=2.33e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0489200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.888; 覆盖度=106.028; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:55094 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.967; 覆盖度=77.933; E 值=1.1e-37 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |