基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G409860 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:103479410-103481898 (+) |
| 描述 | Similar to BPC6: Protein BASIC PENTACYSTEINE6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030528 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g42520 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g21240 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g38910 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g14685 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0130600 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.383; 覆盖度=104.204; E 值=6.33e-132; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009723 | response to ethylene | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.383; 覆盖度=104.204; E 值=6.33e-132; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050793 | regulation of developmental process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.681; 覆盖度=98.799; E 值=8.95e-85; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080157 | regulation of plant-type cell wall organization or biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.252; 覆盖度=33.333; E 值=4.38e-39; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901002 | positive regulation of response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.252; 覆盖度=33.333; E 值=4.38e-39; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.383; 覆盖度=104.204; E 值=6.33e-132; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.383; 覆盖度=104.204; E 值=6.33e-132; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.383; 覆盖度=104.204; E 值=6.33e-132; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000987 | cis-regulatory region sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.252; 覆盖度=33.333; E 值=4.38e-39; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0001222 | transcription corepressor binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.252; 覆盖度=33.333; E 值=4.38e-39; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.383; 覆盖度=104.204; E 值=6.33e-132; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.383; 覆盖度=104.204; E 值=6.33e-132; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.383; 覆盖度=104.204; E 值=6.33e-132; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.383; 覆盖度=104.204; E 值=6.33e-132; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990837 | sequence-specific double-stranded DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.252; 覆盖度=33.333; E 值=4.38e-39; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G14685 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.252; 覆盖度=33.333; E 值=4.38e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G21240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.681; 覆盖度=98.799; E 值=8.95e-85 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G38910 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.846; 覆盖度=97.598; E 值=5.01e-83 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G42520 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.383; 覆盖度=104.204; E 值=6.33e-132 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0130600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.397; 覆盖度=103.003; E 值=1.63e-94 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |