基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G408090 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:102609369-102612223 (-) |
| 描述 | Similar to CYCT1-3: Cyclin-T1-3 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026090 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0485400 |
细胞周期蛋白T1-4。 | 暂无已核实直接文献 |
Os11g0157100 |
细胞周期蛋白T1-3。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0438200 |
细胞周期蛋白T1-2。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009615 | response to virus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.144; 覆盖度=93.456; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=82.935; 覆盖度=59.918; E 值=2.66e-175; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010090 | trichome morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.144; 覆盖度=93.456; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032786 | positive regulation of DNA-templated transcription, elongation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.659; 覆盖度=101.84; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045944 | positive regulation of transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.659; 覆盖度=101.84; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050792 | regulation of viral process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=82.935; 覆盖度=59.918; E 值=2.66e-175; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051301 | cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.659; 覆盖度=101.84; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.659; 覆盖度=101.84; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008024 | cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.659; 覆盖度=101.84; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061575 | cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.659; 覆盖度=101.84; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G19600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.144; 覆盖度=93.456; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G45190 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=82.935; 覆盖度=59.918; E 值=2.66e-175 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0157100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.659; 覆盖度=101.84; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0485400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=81.757; 覆盖度=60.532; E 值=2.25e-175 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |