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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA07G260370
当前查询版本TK1151
位置Chr07:65105568-65106586 (-)
描述Similar to Pectate lyase (Zinnia violacea OX%3D34245)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_029001 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g63180 可能的果胶酸裂解酶22。 暂无已核实直接文献
At4g24780 可能的果胶酸裂解酶18。 暂无已核实直接文献
At3g27400 推定的果胶酸裂解酶11。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0045490pectin catabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.06; 覆盖度=52.964; E 值=2.74e-71; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005576extracellular region细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.11; 覆盖度=82.609; E 值=1.94e-64; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009536plastid细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.11; 覆盖度=82.609; E 值=1.94e-64; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0030570pectate lyase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.06; 覆盖度=52.964; E 值=2.74e-71; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0046872metal ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.06; 覆盖度=52.964; E 值=2.74e-71; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G04680KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=67.164; 覆盖度=52.964; E 值=7.14e-60UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G07010KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.657; 覆盖度=52.964; E 值=2.32e-62UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G63180KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.11; 覆盖度=82.609; E 值=1.94e-64UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGsly:778293KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=79.231; 覆盖度=51.383; E 值=2.73e-61UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release