基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G004520 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:1190815-1193391 (+) |
| 描述 | Similar to At5g51310: Gibberellin 20-oxidase-like protein (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026729 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g51310 |
根毛生长的负调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g55290 |
依赖2-氧代戊二酸(OG)和Fe(II)的双加氧酶(2OGD),参与东莨菪素生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g13610 |
可能作为依赖 2-氧代戊二酸和 Fe²⁺ 的双加氧酶,参与东莨菪素生物合成。 |
Scopoletin is biosynthesized via ortho-hydroxylation of feruloyl CoA by a 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03568.x
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009686 | gibberellin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.025; 覆盖度=93.314; E 值=2.66e-118; UniProt GO evidence=IDA:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009753 | response to jasmonic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.14; 覆盖度=82.849; E 值=6.05e-49; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009805 | coumarin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.468; 覆盖度=89.535; E 值=4.54e-39; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042617 | paclitaxel biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.117; 覆盖度=86.919; E 值=5.51e-50; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048767 | root hair elongation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.025; 覆盖度=93.314; E 值=2.66e-118; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.468; 覆盖度=89.535; E 值=4.54e-39; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.117; 覆盖度=86.919; E 值=5.51e-50; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016491 | oxidoreductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.117; 覆盖度=86.919; E 值=5.51e-50; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016706 | 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.025; 覆盖度=93.314; E 值=2.66e-118; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.025; 覆盖度=93.314; E 值=2.66e-118; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051213 | dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.117; 覆盖度=86.919; E 值=5.51e-50; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G55290 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.468; 覆盖度=89.535; E 值=4.54e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G51310 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.025; 覆盖度=93.314; E 值=2.66e-118 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |