基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G003760 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:989571-991838 (+) |
| 描述 | Similar to ATI2: ATG8-interacting protein 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026719 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g00355 |
可能参与盐胁迫诱导的囊泡到液泡运输途径。 | |
At2g45980 |
参与特殊的应激诱导的质体到液泡的蛋白质运输途径。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0071211 | protein targeting to vacuole involved in autophagy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.959; 覆盖度=102.098; E 值=5.45e-42; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1904962 | plastid to vacuole vesicle-mediated transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.632; 覆盖度=99.65; E 值=2.12e-32; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.959; 覆盖度=102.098; E 值=5.45e-42; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.959; 覆盖度=102.098; E 值=5.45e-42; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.959; 覆盖度=102.098; E 值=5.45e-42; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.632; 覆盖度=99.65; E 值=2.12e-32; UniProt GO evidence=IEA:GOC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.632; 覆盖度=99.65; E 值=2.12e-32; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.632; 覆盖度=99.65; E 值=2.12e-32; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0160247 | autophagy cargo adaptor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.959; 覆盖度=102.098; E 值=5.45e-42; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G45980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.632; 覆盖度=99.65; E 值=2.12e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G00355 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.959; 覆盖度=102.098; E 值=5.45e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |