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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA06G034900
当前查询版本TK1151
位置Chr06:9401539-9405083 (-)
描述Similar to RF298: Putative E3 ubiquitin-protein ligase RF298 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_025904 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g03000 推测的 E3 泛素蛋白连接酶 RF298。 暂无已核实直接文献
At1g03365 推测的 E3 泛素蛋白连接酶 RF4。 暂无已核实直接文献
At1g32530 MND1相互作用蛋白1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.401; 覆盖度=96.767; E 值=3.97e-159; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031398positive regulation of protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.227; 覆盖度=9.81; E 值=1.25e-06; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0051726regulation of cell cycle生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.227; 覆盖度=9.81; E 值=1.25e-06; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0051865protein autoubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.227; 覆盖度=9.81; E 值=1.25e-06; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.401; 覆盖度=96.767; E 值=3.97e-159; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.401; 覆盖度=96.767; E 值=3.97e-159; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004869cysteine-type endopeptidase inhibitor activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.227; 覆盖度=9.81; E 值=1.25e-06; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.401; 覆盖度=96.767; E 值=3.97e-159; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0043027cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.227; 覆盖度=9.81; E 值=1.25e-06; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.401; 覆盖度=96.767; E 值=3.97e-159; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G03365KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.472; 覆盖度=97.882; E 值=2.1e-136UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G32530KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.392; 覆盖度=42.14; E 值=6.26e-48UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G03000KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.401; 覆盖度=96.767; E 值=3.97e-159UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGxla:398387KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.227; 覆盖度=9.81; E 值=1.25e-06UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release