基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA06G014860 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr06:3974836-3975695 (-) |
| 描述 | Similar to SUMO2: Small ubiquitin-related modifier 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026315 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g55160 |
泛素样蛋白,可以作为单体共价连接到靶赖氨酸上。 | |
At4g26840 |
泛素样蛋白,可以作为单体共价连接到靶赖氨酸上。 |
SIZ1 small ubiquitin-like modifier E3 ligase facilitates basal thermotolerance in Arabidopsis independent of salicylic acid.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088831
|
At5g55856 |
泛素样蛋白,可以作为单体共价连接到靶赖氨酸上。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0918300 |
泛素样蛋白,可以作为单体共价连接到靶赖氨酸上。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009408 | response to heat | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.44; 覆盖度=90.099; E 值=3.09e-30; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010286 | heat acclimation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.471; 覆盖度=86.139; E 值=4.85e-28; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016925 | protein sumoylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.44; 覆盖度=90.099; E 值=3.09e-30; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.44; 覆盖度=90.099; E 值=3.09e-30; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.44; 覆盖度=90.099; E 值=3.09e-30; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.44; 覆盖度=90.099; E 值=3.09e-30; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.44; 覆盖度=90.099; E 值=3.09e-30; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031386 | protein tag activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.44; 覆盖度=90.099; E 值=3.09e-30; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0044389 | ubiquitin-like protein ligase binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.44; 覆盖度=90.099; E 值=3.09e-30; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G26840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.471; 覆盖度=86.139; E 值=4.85e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G48710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.796; 覆盖度=97.03; E 值=9.58e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G55160 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.44; 覆盖度=90.099; E 值=3.09e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G55856 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.773; 覆盖度=87.129; E 值=1.64e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0918300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=56.842; 覆盖度=94.059; E 值=2.12e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |