基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA05G462780 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr05:115902344-115905361 (+) |
| 描述 | Similar to XCT: Protein XAP5 CIRCADIAN TIMEKEEPER (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022358 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g21150 |
参与昼夜节律和光形态建成的光调控。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: B8BDW1 |
参与昼夜节律和光形态建成的光调控。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0535300 |
参与昼夜节律和光形态建成的光调控。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006325 | chromatin organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.528; 覆盖度=62.537; E 值=3.34e-79; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009637 | response to blue light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=73.239; 覆盖度=62.832; E 值=7.55e-75; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009873 | ethylene-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=73.239; 覆盖度=62.832; E 值=7.55e-75; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010099 | regulation of photomorphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=73.239; 覆盖度=62.832; E 值=7.55e-75; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010114 | response to red light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=73.239; 覆盖度=62.832; E 值=7.55e-75; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035196 | miRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=73.239; 覆盖度=62.832; E 值=7.55e-75; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042752 | regulation of circadian rhythm | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=73.239; 覆盖度=62.832; E 值=7.55e-75; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048511 | rhythmic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.528; 覆盖度=62.537; E 值=3.34e-79; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.528; 覆盖度=62.537; E 值=3.34e-79; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005654 | nucleoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.706; 覆盖度=60.177; E 值=2.83e-32; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030496 | midbody | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.706; 覆盖度=60.177; E 值=2.83e-32; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045171 | intercellular bridge | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.706; 覆盖度=60.177; E 值=2.83e-32; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G21150 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=73.239; 覆盖度=62.832; E 值=7.55e-75 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0535300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.528; 覆盖度=62.537; E 值=3.34e-79 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dpo:4801527 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.104; 覆盖度=65.192; E 值=1.34e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:108161 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.706; 覆盖度=60.177; E 值=2.83e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |