基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA05G408450 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr05:101555858-101571735 (+) |
| 描述 | Similar to GMI1: Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein GMI1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_021588 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g24280 |
通过体细胞同源重组促进 DNA 双链断裂 (DSB) 修复。 | |
At3g49250 |
RNA 引导的 DNA 甲基化 机制的组成部分，可能通过促进涉及次级 siRNA 的 RNAi 介导的表观遗传修饰和 DNA 甲基化的扩散，从而导致基因沉默。 |
A structural-maintenance-of-chromosomes hinge domain-containing protein is required for RNA-directed DNA methylation.2008 · DOI: 10.1038/ng.119
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000724 | double-strand break repair via homologous recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.708; 覆盖度=72.858; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031047 | regulatory ncRNA-mediated gene silencing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.292; 覆盖度=19.116; E 值=1.98e-108; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080188 | gene silencing by siRNA-directed DNA methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.292; 覆盖度=19.116; E 值=1.98e-108; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000419 | RNA polymerase V complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.292; 覆盖度=19.116; E 值=1.98e-108; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.708; 覆盖度=72.858; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.292; 覆盖度=19.116; E 值=1.98e-108; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G49250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.292; 覆盖度=19.116; E 值=1.98e-108 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G24280 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.708; 覆盖度=72.858; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |