基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA05G408170 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr05:101490373-101491776 (+) |
| 描述 | Similar to TL17: Thylakoid lumenal 17.4 kDa protein%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_021581 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.844; 覆盖度=100.413; E 值=2.43e-106; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.844; 覆盖度=100.413; E 值=2.43e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.844; 覆盖度=100.413; E 值=2.43e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.844; 覆盖度=100.413; E 值=2.43e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.844; 覆盖度=100.413; E 值=2.43e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009543 | chloroplast thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.844; 覆盖度=100.413; E 值=2.43e-106; UniProt GO evidence=HDA:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.844; 覆盖度=100.413; E 值=2.43e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.844; 覆盖度=100.413; E 值=2.43e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031977 | thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.844; 覆盖度=100.413; E 值=2.43e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G12250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=30.252; 覆盖度=49.174; E 值=1.78e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G53490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.844; 覆盖度=100.413; E 值=2.43e-106 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cyt:cce_1272 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=28.455; 覆盖度=50.826; E 值=2.11e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:slr0516 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=34.524; 覆盖度=34.711; E 值=2.37e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |