基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G505410 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:127657739-127658856 (+) |
| 描述 | Similar to PFC1: Ribosomal RNA small subunit methyltransferase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026767 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g47420 |
N6-腺嘌呤甲基转移酶,可修饰植物核 18S rRNA 中 A1785 和 A1786 的 AA 双核苷酸。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031167 | rRNA methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.63; 覆盖度=80.531; E 值=4.09e-55; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000179 | rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016422 | mRNA (2'-O-methyladenosine-N6-)-methyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0052908 | 16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))-dimethyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.63; 覆盖度=80.531; E 值=4.09e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ana:alr3229 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.601; 覆盖度=80.531; E 值=1.15e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G01860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cmu:TC_0633 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.605; 覆盖度=82.891; E 值=1.79e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mta:Moth_0052 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.206; 覆盖度=83.186; E 值=1.32e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |