基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G392820 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:98795792-98799020 (-) |
| 描述 | Similar to PTST: Protein PTST%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_006972 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g27070 |
参与叶绿体中淀粉颗粒的起始。 | |
At5g39790 |
参与将GBSS1靶向至淀粉颗粒。 | |
At5g03420 |
参与叶绿体中淀粉颗粒的起始。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0686900 |
参与复合淀粉颗粒的形成和胚乳中淀粉的合成。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006633 | fatty acid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.769; 覆盖度=31.271; E 值=3.78e-06; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010581 | regulation of starch biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.5; 覆盖度=68.729; E 值=3.93e-89; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019252 | starch biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.5; 覆盖度=68.729; E 值=3.93e-89; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000014 | regulation of endosperm development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.273; 覆盖度=37.801; E 值=1.05e-12; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.769; 覆盖度=31.271; E 值=3.78e-06; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.5; 覆盖度=68.729; E 值=3.93e-89; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.5; 覆盖度=68.729; E 值=3.93e-89; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.154; 覆盖度=26.804; E 值=1.08e-12; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009569 | chloroplast starch grain | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.5; 覆盖度=68.729; E 值=3.93e-89; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.5; 覆盖度=68.729; E 值=3.93e-89; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030247 | polysaccharide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.5; 覆盖度=68.729; E 值=3.93e-89; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2001066 | amylopectin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.273; 覆盖度=37.801; E 值=1.05e-12; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2001070 | starch binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.5; 覆盖度=68.729; E 值=3.93e-89; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2001071 | maltoheptaose binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.154; 覆盖度=26.804; E 值=1.08e-12; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G27070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.154; 覆盖度=26.804; E 值=1.08e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G03420 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.837; 覆盖度=42.268; E 值=2.5e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G39790 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.5; 覆盖度=68.729; E 值=3.93e-89 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0686900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.273; 覆盖度=37.801; E 值=1.05e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |