基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G327300 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:82692677-82693288 (-) |
| 描述 | Similar to CT0009: Uncharacterized RNA methyltransferase CT0009 (Chlorobaculum tepidum (strain ATCC 49652 / DSM 12025 / NBRC 103806 / TLS) OX%3D194439) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032168 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0070475 | rRNA base methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.919; 覆盖度=85.243; E 值=4.02e-107; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.919; 覆盖度=85.243; E 值=4.02e-107; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051539 | 4 iron, 4 sulfur cluster binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.919; 覆盖度=85.243; E 值=4.02e-107; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070041 | rRNA (uridine-C5-)-methyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.919; 覆盖度=85.243; E 值=4.02e-107; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | bca:BCE_0363 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=34.631; 覆盖度=84.722; E 值=1.44e-87 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bha:BH0687 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.066; 覆盖度=84.722; E 值=4.13e-96 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bth:BT_0643 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.875; 覆盖度=83.333; E 值=8.35e-99 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cte:CT0009 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.919; 覆盖度=85.243; E 值=4.02e-107 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pgi:PG_1095 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.413; 覆盖度=83.16; E 值=1.77e-100 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |