基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G308330 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:77793898-77797884 (-) |
| 描述 | Similar to At5g54860: Probable folate-biopterin transporter 4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_037441 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g54860 |
可能介导叶酸转运。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g32040 |
介导参与四氢叶酸生物合成的叶酸单谷氨酸转运。 | |
At5g25050 |
可能介导叶酸转运。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g79710 |
可能介导叶酸转运。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g25040 |
可能介导叶酸转运。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0051958 | methotrexate transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.5; 覆盖度=90.164; E 值=5.72e-58; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0098838 | folate transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.563; 覆盖度=101.23; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.051; 覆盖度=95.902; E 值=1.51e-68; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.5; 覆盖度=90.164; E 值=5.72e-58; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.563; 覆盖度=101.23; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.723; 覆盖度=97.541; E 值=1.46e-60; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008517 | folic acid transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.563; 覆盖度=101.23; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015231 | 5-formyltetrahydrofolate transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.5; 覆盖度=90.164; E 值=5.72e-58; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015350 | methotrexate transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.5; 覆盖度=90.164; E 值=5.72e-58; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G04570 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.343; 覆盖度=96.107; E 值=1.19e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G64890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.051; 覆盖度=95.902; E 值=1.51e-68 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G32040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.5; 覆盖度=90.164; E 值=5.72e-58 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G33280 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.723; 覆盖度=97.541; E 值=1.46e-60 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G54860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.563; 覆盖度=101.23; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |