基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G230640 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:58580165-58582137 (+) |
| 描述 | Similar to ATJ10: Chaperone protein dnaJ 10 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_021781 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 7 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g79260 |
血红素结合蛋白能够清除过亚硝酸盐,并通过充当将过亚硝酸盐转化为硝酸盐的过亚硝酸盐异构酶,保护游离 L-酪氨酸免受过亚硝酸盐介导的硝化。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.826; 覆盖度=52.511; E 值=2.92e-43; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.784; 覆盖度=23.288; E 值=3.31e-14; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.784; 覆盖度=23.288; E 值=3.31e-14; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016853 | isomerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.784; 覆盖度=23.288; E 值=3.31e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0020037 | heme binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.348; 覆盖度=21.005; E 值=5.1e-09; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.784; 覆盖度=23.288; E 值=3.31e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0062213 | peroxynitrite isomerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.348; 覆盖度=21.005; E 值=5.1e-09; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G76700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.826; 覆盖度=52.511; E 值=2.92e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G79260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.784; 覆盖度=23.288; E 值=3.31e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmi:MMAR_1995 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.188; 覆盖度=29.224; E 值=9.78e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | msb:LJ00_32495 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.333; 覆盖度=20.548; E 值=7.54e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | msg:MSMEI_6396 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.333; 覆盖度=20.548; E 值=7.54e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | msm:MSMEG_6574 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.333; 覆盖度=20.548; E 值=7.54e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nfa:NFA_41140 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.348; 覆盖度=21.005; E 值=5.1e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |