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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA04G154140
当前查询版本TK1151
位置Chr04:39869544-39872616 (-)
描述Similar to BHY: Beta-carotene 3-hydroxylase%2C chloroplastic (Gentiana lutea OX%3D38851)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_035207 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g25700 无血红素双铁单加氧酶,参与叶黄素生物合成。 暂无已核实直接文献
At5g52570 无血红素双铁单加氧酶,参与叶黄素生物合成。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0016117carotenoid biosynthetic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.519; 覆盖度=81.654; E 值=1.66e-144; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016119carotene metabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.836; 覆盖度=69.509; E 值=2.26e-148; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafterUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016123xanthophyll biosynthetic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.836; 覆盖度=69.509; E 值=2.26e-148; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafterUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.423; 覆盖度=73.385; E 值=3.11e-143; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031969chloroplast membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.836; 覆盖度=69.509; E 值=2.26e-148; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005506iron ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.423; 覆盖度=73.385; E 值=3.11e-143; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010291beta-carotene 3-hydroxylase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.836; 覆盖度=69.509; E 值=2.26e-148; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016787hydrolase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.836; 覆盖度=69.509; E 值=2.26e-148; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0046872metal ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.836; 覆盖度=69.509; E 值=2.26e-148; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGag:ACF21782KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.836; 覆盖度=69.509; E 值=2.26e-148UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGag:CAA70427KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.153; 覆盖度=81.137; E 值=2.47e-140UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGag:CAA70888KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.519; 覆盖度=81.654; E 值=1.66e-144UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G25700KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.423; 覆盖度=73.385; E 值=3.11e-143UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G52570KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.024; 覆盖度=76.744; E 值=1.41e-134UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGcann:107863219KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.153; 覆盖度=81.137; E 值=2.47e-140UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release