基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G133280 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:34657968-34659692 (+) |
| 描述 | Similar to PSRP1: Ribosome-binding factor PSRP1%2C chloroplastic (Spinacia oleracea OX%3D3562) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035400 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0045900 | negative regulation of translational elongation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.615; 覆盖度=103.654; E 值=2e-121; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.615; 覆盖度=103.654; E 值=2e-121; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022627 | cytosolic small ribosomal subunit | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.615; 覆盖度=103.654; E 值=2e-121; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019843 | rRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.615; 覆盖度=103.654; E 值=2e-121; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.713; 覆盖度=69.435; E 值=1.13e-38; UniProt GO evidence=IDA:DisProt | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043024 | ribosomal small subunit binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.615; 覆盖度=103.654; E 值=2e-121; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | bsu:BSU35310 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.068; 覆盖度=68.439; E 值=1.79e-20 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sha:SH2139 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.884; 覆盖度=68.771; E 值=1.86e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:sll0947 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.713; 覆盖度=69.435; E 值=1.13e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syp:SYNPCC7002_A0263 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.35; 覆盖度=68.439; E 值=1.24e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |