基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G122700 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:31875535-31876435 (-) |
| 描述 | Similar to MFT: Protein MOTHER of FT and TFL1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035575 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g18100 |
可能通过干扰激酶及其效应分子形成与磷酸化配体的复合体(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0157700 |
可能的移动促花信号,从叶子移动到茎尖分生组织并诱导开花。 | |
Os06g0157500 |
可能的移动促花信号,从叶子移动到茎尖分生组织并诱导开花。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=81.019; E 值=5.76e-42; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009738 | abscisic acid-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=81.019; E 值=5.76e-42; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009910 | negative regulation of flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.916; 覆盖度=77.315; E 值=2.76e-37; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010030 | positive regulation of seed germination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=81.019; E 值=5.76e-42; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010228 | vegetative to reproductive phase transition of meristem | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.916; 覆盖度=77.315; E 值=2.76e-37; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000028 | regulation of photoperiodism, flowering | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.452; 覆盖度=77.778; E 值=1.62e-37; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=81.019; E 值=5.76e-42; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=81.019; E 值=5.76e-42; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G18100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=81.019; E 值=5.76e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bdi:100838275 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.452; 覆盖度=77.778; E 值=1.62e-37 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0498800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.888; 覆盖度=82.407; E 值=6.95e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |