基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G104480 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:27225856-27230022 (+) |
| 描述 | Similar to RH28: DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_003168 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g16630 |
DEAD-box ATP依赖性RNA解旋酶28。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0481100 |
DEAD-box ATP依赖性RNA解旋酶28。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000027 | ribosomal large subunit assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.14; 覆盖度=74.219; E 值=9.73e-29; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblFungi | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006364 | rRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.14; 覆盖度=74.219; E 值=9.73e-29; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblFungi | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010467 | gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.953; 覆盖度=44.792; E 值=2.66e-26; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042254 | ribosome biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.953; 覆盖度=44.792; E 值=2.66e-26; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.741; 覆盖度=60.417; E 值=5.66e-57; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.741; 覆盖度=60.417; E 值=5.66e-57; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.953; 覆盖度=44.792; E 值=2.66e-26; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030687 | preribosome, large subunit precursor | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.14; 覆盖度=74.219; E 值=9.73e-29; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblFungi | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.741; 覆盖度=60.417; E 值=5.66e-57; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003724 | RNA helicase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.741; 覆盖度=60.417; E 值=5.66e-57; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.741; 覆盖度=60.417; E 值=5.66e-57; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016887 | ATP hydrolysis activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.741; 覆盖度=60.417; E 值=5.66e-57; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G16630 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.741; 覆盖度=60.417; E 值=5.66e-57 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0481100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.466; 覆盖度=57.552; E 值=1.78e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mgr:MGG_07718 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.953; 覆盖度=44.792; E 值=2.66e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | uma:UMAG_03170 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.14; 覆盖度=74.219; E 值=9.73e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |