基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G081480 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:21395259-21396398 (+) |
| 描述 | Similar to truB: tRNA pseudouridine synthase B (Parabacteroides distasonis (strain ATCC 8503 / DSM 20701 / CIP 104284 / JCM 5825 / NCTC 11152) OX%3D435591) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_007325 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006400 | tRNA modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.296; 覆盖度=47.788; E 值=6.6e-10; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031119 | tRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.909; 覆盖度=77.876; E 值=5.91e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990481 | mRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.909; 覆盖度=77.876; E 值=5.91e-14; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.909; 覆盖度=77.876; E 值=5.91e-14; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009982 | pseudouridine synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.296; 覆盖度=47.788; E 值=6.6e-10; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0160148 | tRNA pseudouridine(55) synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.909; 覆盖度=77.876; E 值=5.91e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | bfr:BF0057 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.148; 覆盖度=47.788; E 值=8.39e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bfs:BF9343_0068 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.148; 覆盖度=47.788; E 值=8.39e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bth:BT_3213 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.296; 覆盖度=47.788; E 值=6.6e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bvu:BVU_1172 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.095; 覆盖度=74.336; E 值=4.92e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pdi:BDI_2406 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.909; 覆盖度=77.876; E 值=5.91e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |