基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G058720 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:15665108-15668267 (-) |
| 描述 | Similar to V2: Guanylate kinase 2%2C chloroplastic/mitochondrial (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022065 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0515600 |
对于回收 GMP 和间接 cGMP 至关重要。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0048638 | regulation of developmental growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.254; 覆盖度=98.333; E 值=2.99e-110; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.973; 覆盖度=91.25; E 值=8.9e-119; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.973; 覆盖度=91.25; E 值=8.9e-119; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.973; 覆盖度=91.25; E 值=8.9e-119; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004385 | GMP kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.973; 覆盖度=91.25; E 值=8.9e-119; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.973; 覆盖度=91.25; E 值=8.9e-119; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G06200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.254; 覆盖度=98.333; E 值=2.99e-110 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cdf:CD630_25880 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.796; 覆盖度=81.667; E 值=3e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | deh:cbdbA42 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.386; 覆盖度=78.75; E 值=1.15e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | det:DET0035 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.503; 覆盖度=79.583; E 值=1.87e-49 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0320900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.973; 覆盖度=91.25; E 值=8.9e-119 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pdc:CDIF630_02842 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.796; 覆盖度=81.667; E 值=3e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |