基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G018040 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:4534862-4537225 (+) |
| 描述 | Similar to At3g58180: Deoxyhypusine hydroxylase (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036900 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g58180 |
催化N(6)-(4-氨基丁基)-L-赖氨酸中间体的羟基化形成hypusine,这是一种仅在成熟eIF-5A因子中发现的必需翻译后修饰。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0626100 |
催化N(6)-(4-氨基丁基)-L-赖氨酸中间体的羟基化形成hypusine,这是一种仅在成熟eIF-5A因子中发现的必需翻译后修饰。 | 暂无已核实直接文献 |
Os12g0163300 |
催化N(6)-(4-氨基丁基)-L-赖氨酸中间体的羟基化形成hypusine,这是一种仅在成熟eIF-5A因子中发现的必需翻译后修饰。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0008612 | peptidyl-lysine modification to peptidyl-hypusine | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.181; 覆盖度=95.513; E 值=2.47e-166; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005506 | iron ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.0; 覆盖度=90.385; E 值=6.89e-86; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016491 | oxidoreductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.181; 覆盖度=95.513; E 值=2.47e-166; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019135 | deoxyhypusine monooxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.181; 覆盖度=95.513; E 值=2.47e-166; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.181; 覆盖度=95.513; E 值=2.47e-166; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G58180 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.181; 覆盖度=95.513; E 值=2.47e-166 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0163300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=73.29; 覆盖度=98.397; E 值=5.78e-156 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rno:314644 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.0; 覆盖度=90.385; E 值=6.89e-86 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |