基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G016820 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:4194615-4195900 (-) |
| 描述 | Similar to Os03g0743400: Probable histone H2A variant 3 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_036930 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g54560 |
H2A变异组蛋白，可能在一部分核小体中替代常规H2A。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g38810 |
变体组蛋白H2A在整个细胞周期中合成，与经典的S期调控H2A差异很大。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0743400 |
变体组蛋白H2A在整个细胞周期中合成，与经典的S期调控H2A差异很大。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0162200 |
变体组蛋白H2A在整个细胞周期中合成，与经典的S期调控H2A差异很大。 | 暂无已核实直接文献 |
Os10g0418000 |
变体组蛋白H2A在整个细胞周期中合成，与经典的S期调控H2A差异很大。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006970 | response to osmotic stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.971; 覆盖度=100.0; E 值=1.03e-76; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010468 | regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.971; 覆盖度=100.0; E 值=1.03e-76; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016048 | detection of temperature stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.971; 覆盖度=100.0; E 值=1.03e-76; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031507 | heterochromatin formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.321; 覆盖度=100.735; E 值=6.69e-77; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.971; 覆盖度=100.0; E 值=1.03e-76; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000786 | nucleosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.321; 覆盖度=100.735; E 值=6.69e-77; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.321; 覆盖度=100.735; E 值=6.69e-77; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=85.294; 覆盖度=100.0; E 值=2.42e-75; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.321; 覆盖度=100.735; E 值=6.69e-77; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030527 | structural constituent of chromatin | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.321; 覆盖度=100.735; E 值=6.69e-77; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046982 | protein heterodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.321; 覆盖度=100.735; E 值=6.69e-77; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G38810 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=85.294; 覆盖度=100.0; E 值=2.42e-75 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G54560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.971; 覆盖度=100.0; E 值=1.03e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0162200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=84.783; 覆盖度=101.471; E 值=5.39e-72 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0743400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.321; 覆盖度=100.735; E 值=6.69e-77 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os10g0418000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=87.05; 覆盖度=102.206; E 值=5.39e-71 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |