基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G011050 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:2661772-2663560 (+) |
| 描述 | Similar to RPH1: Protein RESISTANCE TO PHYTOPHTHORA 1%2C chloroplastic (Solanum tuberosum OX%3D4113) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_037009 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g48070 |
在对卵菌 P.brassicae 的免疫反应中发挥积极作用,包括诱导氧化爆发(如 H(2)O(2))和增强防御相关基因的表达。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0002229 | defense response to oomycetes | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.112; 覆盖度=63.274; E 值=1.04e-89; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.192; 覆盖度=101.327; E 值=1.1e-95; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010729 | positive regulation of hydrogen peroxide biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.112; 覆盖度=63.274; E 值=1.04e-89; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050665 | hydrogen peroxide biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.192; 覆盖度=101.327; E 值=1.1e-95; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1902290 | positive regulation of defense response to oomycetes | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.192; 覆盖度=101.327; E 值=1.1e-95; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.112; 覆盖度=63.274; E 值=1.04e-89; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.192; 覆盖度=101.327; E 值=1.1e-95; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.112; 覆盖度=63.274; E 值=1.04e-89; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.192; 覆盖度=101.327; E 值=1.1e-95; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G48070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.112; 覆盖度=63.274; E 值=1.04e-89 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sot:102592434 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.192; 覆盖度=101.327; E 值=1.1e-95 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |