基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G500480 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:125663729-125667627 (+) |
| 描述 | Similar to ENT3: Equilibrative nucleotide transporter 3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_010120 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g05120 |
核苷转运蛋白,在所有器官中充当嘧啶核苷载体。 |
Equilibrative nucleoside transporters of Arabidopsis thaliana. cDNA cloning, expression pattern, and analysis of transport activities.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m304768200 Characterization of three novel members of the Arabidopsis thaliana equilibrative nucleoside transporter (ENT) family.2004 · DOI: 10.1042/bj20040389
|
At4g05140 |
可能参与核苷运输。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g05110 |
当在异源系统中表达时,可以介导腺苷、尿苷、鸟苷或胞苷的摄取的核苷转运蛋白。 | |
At4g05130 |
当在异源系统中表达时,可以介导腺苷、尿苷、鸟苷或胞苷的摄取的核苷转运蛋白。 | |
At1g61630 |
核苷转运蛋白,在异源系统(酵母)中表达时,可以介导腺苷、尿苷、鸟苷或胞苷的摄取。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0015858 | nucleoside transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.439; 覆盖度=29.653; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.871; 覆盖度=29.512; E 值=8.28e-178; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.439; 覆盖度=29.653; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005337 | nucleoside transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.439; 覆盖度=29.653; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G05110 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.871; 覆盖度=29.512; E 值=8.28e-178 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G05120 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.439; 覆盖度=29.653; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G05140 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.83; 覆盖度=29.512; E 值=1.12e-179 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |