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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA03G398490
当前查询版本TK1151
位置Chr03:99048104-99048970 (-)
描述Similar to ATL3: RING-H2 finger protein ATL3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_009102 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g53820 RING-H2指蛋白ATL60。 暂无已核实直接文献
At1g72310 RING-H2锌指蛋白ATL3。 暂无已核实直接文献
At3g16720 可能参与植物防御信号通路的早期阶段。 暂无已核实直接文献
At3g62690 RING-H2 指蛋白 ATL5。 暂无已核实直接文献
At2g47560 RING-H2 指蛋白 ATL64。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006952defense response生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.448; 覆盖度=102.749; E 值=1.95e-39; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.911; 覆盖度=108.591; E 值=1.84e-47; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042631cellular response to water deprivation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.459; 覆盖度=25.43; E 值=2.98e-25; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0065003protein-containing complex assembly生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=36.735; 覆盖度=50.515; E 值=3.27e-25; UniProt GO evidence=TAS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.911; 覆盖度=108.591; E 值=1.84e-47; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.459; 覆盖度=25.43; E 值=2.98e-25; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.911; 覆盖度=108.591; E 值=1.84e-47; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016020membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.448; 覆盖度=102.749; E 值=1.95e-39; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.911; 覆盖度=108.591; E 值=1.84e-47; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.911; 覆盖度=108.591; E 值=1.84e-47; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061659ubiquitin-like protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=36.735; 覆盖度=50.515; E 值=3.27e-25; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G53820KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.986; 覆盖度=100.344; E 值=1.33e-45UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G72310KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.911; 覆盖度=108.591; E 值=1.84e-47UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G14320KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.459; 覆盖度=25.43; E 值=2.98e-25UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G16720KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.448; 覆盖度=102.749; E 值=1.95e-39UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G62690KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=36.735; 覆盖度=50.515; E 值=3.27e-25UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release