基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G604910 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:156013564-156019705 (-) |
| 描述 | Similar to CPSF100: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_011905 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g23880 |
CPSF 在前 mRNA 3' 端形成中起关键作用,识别 AAUAAA 信号序列,并与多聚腺苷酸聚合酶及其他因子相互作用,从而实现切割和多腺苷酸添加(类比推测)。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0569400 |
CPSF 在前 mRNA 3' 端形成中起关键作用,识别 AAUAAA 信号序列,并与多聚腺苷酸聚合酶及其他因子相互作用,实现剪切和加尾多聚腺苷酸。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006398 | mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.748; 覆盖度=100.539; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031124 | mRNA 3'-end processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.577; 覆盖度=109.03; E 值=1.01e-178; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035194 | regulatory ncRNA-mediated post-transcriptional gene silencing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.748; 覆盖度=100.539; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071045 | nuclear histone mRNA catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.325; 覆盖度=106.199; E 值=0.0; UniProt GO evidence=NAS:ComplexPortal | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0180010 | co-transcriptional mRNA 3'-end processing, cleavage and polyadenylation pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.325; 覆盖度=106.199; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:FlyBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.748; 覆盖度=100.539; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.748; 覆盖度=100.539; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005847 | mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.748; 覆盖度=100.539; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.748; 覆盖度=100.539; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.748; 覆盖度=100.539; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G23880 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.748; 覆盖度=100.539; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bta:327689 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=37.206; 覆盖度=109.03; E 值=3.49e-178 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dme:Dmel_CG1957 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.325; 覆盖度=106.199; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0569400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.029; 覆盖度=100.674; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:51786 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.577; 覆盖度=109.03; E 值=1.01e-178 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |