基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G594120 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:153285965-153291322 (-) |
| 描述 | Similar to FUC1: Alpha-L-fucosidase 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_011998 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g28100 |
水解 Lewis 决定基中 3- 和 4- 连接的岩藻糖。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0560400 |
Alpha-L-岩藻糖苷酶负责水解连接到糖蛋白碳水化合物部分还原端N-乙酰氨基葡萄糖的α-1,6-连接岩藻糖。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006004 | fucose metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.386; 覆盖度=93.827; E 值=9.54e-177; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006516 | glycoprotein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.386; 覆盖度=93.827; E 值=9.54e-177; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009617 | response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.61; 覆盖度=67.49; E 值=2.23e-06; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016139 | glycoside catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.386; 覆盖度=93.827; E 值=9.54e-177; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000535 | regulation of entry of bacterium into host cell | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.61; 覆盖度=67.49; E 值=2.23e-06; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000325 | plant-type vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.386; 覆盖度=93.827; E 值=9.54e-177; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.386; 覆盖度=93.827; E 值=9.54e-177; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005615 | extracellular space | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.61; 覆盖度=67.49; E 值=2.23e-06; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005764 | lysosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.386; 覆盖度=93.827; E 值=9.54e-177; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005788 | endoplasmic reticulum lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.61; 覆盖度=67.49; E 值=2.23e-06; UniProt GO evidence=TAS:Reactome | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035578 | azurophil granule lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.61; 覆盖度=67.49; E 值=2.23e-06; UniProt GO evidence=TAS:Reactome | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048046 | apoplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.386; 覆盖度=93.827; E 值=9.54e-177; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070062 | extracellular exosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.61; 覆盖度=67.49; E 值=2.23e-06; UniProt GO evidence=HDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0099503 | secretory vesicle | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.386; 覆盖度=93.827; E 值=9.54e-177; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004560 | alpha-L-fucosidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.386; 覆盖度=93.827; E 值=9.54e-177; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G28100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.386; 覆盖度=93.827; E 值=9.54e-177 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:2519 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.61; 覆盖度=67.49; E 值=2.23e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |