基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G508300 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:130451852-130453774 (+) |
| 描述 | Similar to PDF1B: Peptide deformylase 1B%2C chloroplastic (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_013278 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g14660 |
去除新合成蛋白质 N 端 Met 的甲酰基。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0637600 |
去除新合成蛋白质 N 端 Met 的甲酰基。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.288; 覆盖度=91.829; E 值=3.98e-100; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.65; 覆盖度=106.615; E 值=2.04e-98; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.288; 覆盖度=91.829; E 值=3.98e-100; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.65; 覆盖度=106.615; E 值=2.04e-98; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.65; 覆盖度=106.615; E 值=2.04e-98; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042586 | peptide deformylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.288; 覆盖度=91.829; E 值=3.98e-100; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.288; 覆盖度=91.829; E 值=3.98e-100; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G14660 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.65; 覆盖度=106.615; E 值=2.04e-98 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0637600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=59.135; 覆盖度=80.934; E 值=1.73e-84 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rba:RB12856 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=34.555; 覆盖度=74.319; E 值=1.16e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:543648 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.288; 覆盖度=91.829; E 值=3.98e-100 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syp:SYNPCC7002_A2348 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.868; 覆盖度=70.817; E 值=3.08e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |