基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G489940 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:125265474-125269432 (+) |
| 描述 | Similar to FPP7: Filament-like plant protein 7 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_013560 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g23360 |
纤维状植物蛋白7。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g77580 |
似丝状植物蛋白1。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g05270 |
与COG2和FPP2/VETH2形成复合物,在木质部细胞次生细胞壁沉积过程中,通过招募EXO70A1,将胞吐复合体(exocyst)组分招募至皮层微管,确保正确的次生细胞壁(SCW)沉积模式。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g21810 |
与FPP3/VETH1和COG2形成复合物,在木质部细胞次生细胞壁沉积过程中,通过招募EXO70A1,将胞吐复合体(exocyst)组分招募至皮层微管,确保正确的次生细胞壁(SCW)沉积模式。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010090 | trichome morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=55.752; E 值=1.34e-40; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046785 | microtubule polymerization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=55.752; E 值=1.34e-40; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.8; 覆盖度=36.873; E 值=1.72e-34; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.642; 覆盖度=62.979; E 值=2.86e-60; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008017 | microtubule binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=55.752; E 值=1.34e-40; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G19835 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=55.752; E 值=1.34e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G47900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.002; 覆盖度=63.274; E 值=1.17e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G23360 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.642; 覆盖度=62.979; E 值=2.86e-60 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G36120 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.8; 覆盖度=36.873; E 值=1.72e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |