基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G420790 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:106867891-106872586 (-) |
| 描述 | Similar to Z-ISO: 15-cis-zeta-carotene isomerase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_014497 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g10830 |
异构酶参与类胡萝卜素的生物合成。 | |
At1g60730 |
可能的醛酮还原酶5。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g60750 |
可能的醛-酮还原酶6。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2XRZ0 |
可能的醛酮还原酶2。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016120 | carotene biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.585; 覆盖度=57.722; E 值=6.29e-172; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.898; 覆盖度=37.838; E 值=4.76e-40; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.898; 覆盖度=37.838; E 值=4.76e-40; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=56.693; 覆盖度=24.517; E 值=2.4e-39; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.585; 覆盖度=57.722; E 值=6.29e-172; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.585; 覆盖度=57.722; E 值=6.29e-172; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008106 | alcohol dehydrogenase (NADP+) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.898; 覆盖度=37.838; E 值=4.76e-40; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090471 | 9,15,9'-tri-cis-zeta-carotene isomerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.585; 覆盖度=57.722; E 值=6.29e-172; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G10830 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.585; 覆盖度=57.722; E 值=6.29e-172 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G60680 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=56.349; 覆盖度=24.324; E 值=4.17e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G60710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=56.693; 覆盖度=24.517; E 值=2.4e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G60730 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.898; 覆盖度=37.838; E 值=4.76e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:100194203 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.607; 覆盖度=58.494; E 值=3.52e-157 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |