基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G379230 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:96430875-96432426 (+) |
| 描述 | Similar to RIC4: CRIB domain-containing protein RIC4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_014979 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g16490 |
作为“植物 Rho” 家族的 Rho 相关 GTP 结合蛋白的下游效应子。 |
A genome-wide analysis of Arabidopsis Rop-interactive CRIB motif-containing proteins that act as Rop GTPase targets.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010218 Arabidopsis interdigitating cell growth requires two antagonistic pathways with opposing action on cell morphogenesis.2005 · DOI: 10.1016/j.cell.2004.12.026
|
At1g27380 |
作为“植物 Rho”(ROP) 家族的 Rho 相关 GTP 结合蛋白的下游效应子。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g04900 |
作为“植物 Rho”(ROP) 家族的 Rho 相关 GTP 结合蛋白的下游效应子。 | |
At4g28556 |
作为“植物 Rho”(ROP) 家族的 Rho 相关 GTP 结合蛋白的下游效应子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g03982 |
作为“植物 Rho”(ROP) 家族的 Rho 相关 GTP 结合蛋白的下游效应子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=26.042; E 值=1.43e-08; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009860 | pollen tube growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.857; 覆盖度=72.917; E 值=1.04e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010215 | cellulose microfibril organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.857; 覆盖度=72.917; E 值=1.04e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0017157 | regulation of exocytosis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.857; 覆盖度=72.917; E 值=1.04e-19; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030833 | regulation of actin filament polymerization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.857; 覆盖度=72.917; E 值=1.04e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051650 | establishment of vesicle localization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.857; 覆盖度=72.917; E 值=1.04e-19; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=26.042; E 值=1.43e-08; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=26.042; E 值=1.43e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.857; 覆盖度=72.917; E 值=1.04e-19; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.857; 覆盖度=72.917; E 值=1.04e-19; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016324 | apical plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.857; 覆盖度=72.917; E 值=1.04e-19; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G03982 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.372; 覆盖度=44.792; E 值=8.41e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G20430 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.0; 覆盖度=26.042; E 值=1.08e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G04900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.17; 覆盖度=27.604; E 值=5.89e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G28556 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=26.042; E 值=1.43e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G16490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.857; 覆盖度=72.917; E 值=1.04e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |