基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G174660 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:44978831-44983374 (-) |
| 描述 | Similar to FIM5: Fimbrin-5 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_016205 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g26700 |
以不依赖于钙的方式交联肌动蛋白丝。 | |
At5g35700 |
以不依赖于钙的方式交联肌动蛋白丝。 | |
At5g55400 |
交联肌动蛋白丝(F-肌动蛋白)。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g04750 |
交联肌动蛋白丝(F-肌动蛋白)。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g48460 |
交联肌动蛋白丝(F-肌动蛋白)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007623 | circadian rhythm | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.381; 覆盖度=83.681; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009846 | pollen germination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.977; 覆盖度=81.595; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009860 | pollen tube growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.977; 覆盖度=81.595; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030036 | actin cytoskeleton organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.977; 覆盖度=81.595; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051017 | actin filament bundle assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.977; 覆盖度=81.595; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051639 | actin filament network formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.977; 覆盖度=81.595; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000325 | plant-type vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=67.914; 覆盖度=85.276; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.977; 覆盖度=81.595; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005884 | actin filament | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.977; 覆盖度=81.595; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.053; 覆盖度=82.577; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.381; 覆盖度=83.681; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032432 | actin filament bundle | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.977; 覆盖度=81.595; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.381; 覆盖度=83.681; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051015 | actin filament binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.977; 覆盖度=81.595; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G04750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.053; 覆盖度=82.577; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G26700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.381; 覆盖度=83.681; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G35700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.977; 覆盖度=81.595; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G48460 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=63.959; 覆盖度=83.067; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G55400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=67.914; 覆盖度=85.276; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |