基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G131320 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:34006314-34008387 (+) |
| 描述 | Similar to ARP8: Actin-related protein 8 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018582 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g56180 |
相关肌动蛋白蛋白8。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g22920 |
COP9信号体复合物(CSN)可能的蛋白酶亚基,该复合物参与多种细胞和发育过程,如光形态建成以及生长素和茉莉酸反应。 | |
At1g71230 |
COP9信号体复合物(CSN)可能的蛋白酶亚基,该复合物参与多种细胞和发育过程,如光形态建成以及生长素和茉莉酸反应。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0654700 |
可能是COP9信号体复合物(CSN)的蛋白酶亚基,该复合物参与各种细胞和发育过程,如光形态发生和对激素的反应(类比)。 | |
UniProt: A8WAT2 |
相关肌动蛋白蛋白8。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0030029 | actin filament-based process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.793; 覆盖度=11.048; E 值=2.1e-14; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.793; 覆盖度=11.048; E 值=2.1e-14; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.793; 覆盖度=11.048; E 值=2.1e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.793; 覆盖度=11.048; E 值=2.1e-14; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.793; 覆盖度=11.048; E 值=2.1e-14; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015629 | actin cytoskeleton | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.793; 覆盖度=11.048; E 值=2.1e-14; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.793; 覆盖度=11.048; E 值=2.1e-14; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.793; 覆盖度=11.048; E 值=2.1e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G56180 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.793; 覆盖度=11.048; E 值=2.1e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0667700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.0; 覆盖度=8.571; E 值=2.69e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |