基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G069190 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:17977931-17987877 (-) |
| 描述 | Similar to EX1: Protein EXECUTER 1%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_017200 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g33630 |
与EX2共同使高等植物感知质体中的单线态氧胁迫信号,激活遗传决定的核胁迫应答程序,继而触发程序性细胞死亡(PCD)。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g27510 |
与EX1一起,使高等植物能够将单线态氧感知为质体中的应激信号,从而激活基因决定的核应激反应程序,诱发程序性细胞死亡(PCD)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os10g0485300 |
与EX2共同使高等植物感知质体中的单线态氧胁迫信号,激活遗传决定的核胁迫应答程序,继而触发程序性细胞死亡(PCD)。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0107900 |
与EX1一起,使高等植物能够将单线态氧感知为质体中的应激信号,从而激活基因决定的核应激反应程序,诱发程序性细胞死亡(PCD)。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000304 | response to singlet oxygen | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.058; 覆盖度=105.857; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010343 | singlet oxygen-mediated programmed cell death | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.058; 覆盖度=105.857; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.058; 覆盖度=105.857; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.058; 覆盖度=105.857; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042651 | thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.058; 覆盖度=105.857; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G27510 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.849; 覆盖度=85.359; E 值=1.34e-103 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G33630 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.058; 覆盖度=105.857; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0107900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.879; 覆盖度=86.969; E 值=8.06e-108 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os10g0485300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.97; 覆盖度=98.097; E 值=1.14e-120 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |