基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G052710 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:13769593-13774424 (+) |
| 描述 | Similar to XYN5: Endo-1%2C4-beta-xylanase 5 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_017319 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0045493 | xylan catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.612; 覆盖度=55.728; E 值=5.09e-122; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.612; 覆盖度=55.728; E 值=5.09e-122; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.612; 覆盖度=55.728; E 值=5.09e-122; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031176 | endo-1,4-beta-xylanase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.612; 覆盖度=55.728; E 值=5.09e-122; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G10050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.487; 覆盖度=55.847; E 值=4.04e-52 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G58370 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.362; 覆盖度=67.9; E 值=1.13e-52 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G14690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.059; 覆盖度=64.2; E 值=1.96e-108 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G33810 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.612; 覆盖度=55.728; E 值=5.09e-122 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G33820 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.286; 覆盖度=63.484; E 值=1.41e-119 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |