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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA02G025500
当前查询版本TK1151
位置Chr02:6156772-6158600 (+)
描述Similar to PG1: Polygalacturonase (Nicotiana tabacum OX%3D4097)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_017617 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g07850 可能在花粉发育、萌发和花粉管生长过程中参与果胶的解聚功能。 暂无已核实直接文献
At1g02790 可能在花粉发育、萌发和花粉管生长过程中参与果胶的解聚功能。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0005975carbohydrate metabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.082; 覆盖度=98.489; E 值=2.56e-123; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0071555cell wall organization生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.082; 覆盖度=98.489; E 值=2.56e-123; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005576extracellular region细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.082; 覆盖度=98.489; E 值=2.56e-123; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004650polygalacturonase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.082; 覆盖度=98.489; E 值=2.56e-123; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0047911galacturan 1,4-alpha-galacturonidase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.475; 覆盖度=91.184; E 值=1.37e-108; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGghi:107942091KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=43.544; 覆盖度=99.496; E 值=7.21e-108UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release