基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G019860 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:4646570-4652918 (-) |
| 描述 | Similar to At3g07870: F-box protein At3g07870 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_017637 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g23880 |
F-box/kelch重复蛋白At3g23880。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g10240 |
推测的 F-box 蛋白 At3g10240。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g43260 |
F-box/LRR重复蛋白At2g43260。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g16740 |
SCF(ASK-cullin-F-box) E3 泛素连接酶复合物的组成部分,可能介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g50870 |
推测的 F-box 蛋白 At1g50870。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0008284 | positive regulation of cell population proliferation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=24.031; 覆盖度=96.03; E 值=6.51e-15; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.386; 覆盖度=59.801; E 值=3.9e-09; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=24.031; 覆盖度=96.03; E 值=6.51e-15; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=24.031; 覆盖度=96.03; E 值=6.51e-15; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G30920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.258; 覆盖度=96.278; E 值=8.01e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G06240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=26.136; 覆盖度=87.345; E 值=3.3e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G07870 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=24.031; 覆盖度=96.03; E 值=6.51e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G23880 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.438; 覆盖度=47.643; E 值=6.36e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G49610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.386; 覆盖度=59.801; E 值=3.9e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |