基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G578460 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:145445835-145449583 (+) |
| 描述 | Similar to PSB28: Photosystem II reaction center PSB28 protein%2C chloroplastic (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_000893 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g28660 |
光系统II反应中心PSB28蛋白，叶绿体类型。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0938100 |
光系统II反应中心PSB28蛋白，叶绿体类型。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0015979 | photosynthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.889; 覆盖度=99.448; E 值=2.01e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.111; 覆盖度=79.558; E 值=1.11e-62; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.111; 覆盖度=79.558; E 值=1.11e-62; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009523 | photosystem II | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.386; 覆盖度=62.983; E 值=1.85e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.889; 覆盖度=99.448; E 值=2.01e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.111; 覆盖度=79.558; E 值=1.11e-62; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.111; 覆盖度=79.558; E 值=1.11e-62; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009654 | photosystem II oxygen evolving complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.889; 覆盖度=99.448; E 值=2.01e-74; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G28660 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.111; 覆盖度=79.558; E 值=1.11e-62 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0938100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.889; 覆盖度=99.448; E 值=2.01e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ota:OT_ostta16g00650 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=59.633; 覆盖度=60.221; E 值=7.1e-44 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |