基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G576170 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:144890730-144891674 (+) |
| 描述 | Similar to SCR: Protein SCARECROW (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000921 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g54220 |
转录因子,参与静止中心细胞的特化以及周围干细胞的维持,并参与根部径向模式形成过程中非对称细胞分裂。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2ZAX5 |
转录因子,参与静止中心细胞的特化以及周围干细胞的维持,并参与根部径向模式形成过程中非对称细胞分裂。 | 暂无已核实直接文献 |
Os11g0124300 |
转录因子,参与静止中心细胞的特化以及周围干细胞的维持,并参与根部径向模式形成过程中非对称细胞分裂。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008356 | asymmetric cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009610 | response to symbiotic fungus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.902; 覆盖度=72.414; E 值=1.76e-134; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009630 | gravitropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009956 | radial pattern formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045454 | cell redox homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048364 | root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048366 | leaf development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051457 | maintenance of protein location in nucleus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090610 | bundle sheath cell fate specification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G54220 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.478; 覆盖度=82.353; E 值=1.88e-138 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0124300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.333; 覆盖度=76.065; E 值=1.79e-132 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |