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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA01G549020
当前查询版本TK1151
位置Chr01:137913622-137915447 (+)
描述Similar to CPR1: F-box protein CPR1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_001298 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g12560 SCF(ASK- Cullin-F-box) E3泛素连接酶复合物的组分,可能介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解(通过相似性)。
At4g22390 F-box蛋白 At4g22390。 暂无已核实直接文献
At3g06240 F-box/kelch 重复蛋白 At3g06240。 暂无已核实直接文献
At3g07870 F-box 蛋白 At3g07870。 暂无已核实直接文献
At5g07610 F-box蛋白 At5g07610。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0008284positive regulation of cell population proliferation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.982; 覆盖度=86.198; E 值=1.89e-23; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009626plant-type hypersensitive response生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.695; 覆盖度=108.594; E 值=2.03e-50; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.695; 覆盖度=108.594; E 值=2.03e-50; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031348negative regulation of defense response生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.695; 覆盖度=108.594; E 值=2.03e-50; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042177negative regulation of protein catabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.695; 覆盖度=108.594; E 值=2.03e-50; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.695; 覆盖度=108.594; E 值=2.03e-50; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.695; 覆盖度=108.594; E 值=2.03e-50; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009506plasmodesma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.982; 覆盖度=86.198; E 值=1.89e-23; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G06240KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.717; 覆盖度=95.833; E 值=5.33e-22UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G07870KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.982; 覆盖度=86.198; E 值=1.89e-23UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G23880KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.118; 覆盖度=88.542; E 值=2.3e-27UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G12560KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.695; 覆盖度=108.594; E 值=2.03e-50UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G22390KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=30.673; 覆盖度=104.427; E 值=2.06e-46UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release