基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G485170 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:121444877-121446382 (+) |
| 描述 | Similar to IAA17: Auxin-responsive protein IAA17 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002065 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g04250 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g14550 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0178500 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0178600 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0597000 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.416; 覆盖度=104.739; E 值=2.12e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.148; 覆盖度=102.37; E 值=1.07e-51; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.416; 覆盖度=104.739; E 值=2.12e-55; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.416; 覆盖度=104.739; E 值=2.12e-55; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010102 | lateral root morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.649; 覆盖度=105.213; E 值=9.73e-55; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.649; 覆盖度=105.213; E 值=9.73e-55; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1900057 | positive regulation of leaf senescence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.416; 覆盖度=104.739; E 值=2.12e-55; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.416; 覆盖度=104.739; E 值=2.12e-55; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.649; 覆盖度=105.213; E 值=9.73e-55; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.416; 覆盖度=104.739; E 值=2.12e-55; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.416; 覆盖度=104.739; E 值=2.12e-55; UniProt GO evidence=IPI:IntAct | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G04250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.416; 覆盖度=104.739; E 值=2.12e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G04730 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.494; 覆盖度=110.427; E 值=7.32e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.649; 覆盖度=105.213; E 值=9.73e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0178500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.805; 覆盖度=97.156; E 值=1.69e-51 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0178600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.148; 覆盖度=102.37; E 值=1.07e-51 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |