基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G477020 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:119470413-119471669 (-) |
| 描述 | Similar to At3g13980: Protein BIG GRAIN 1-like A (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002177 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g13980 |
参与生长素运输。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g54200 |
参与生长素运输。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g42800 |
参与生长素运输。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0175800 |
参与生长素运输。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: B8APC7 |
参与生长素运输。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007623 | circadian rhythm | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.914; 覆盖度=55.742; E 值=6.35e-07; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009630 | gravitropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.952; 覆盖度=25.12; E 值=5.32e-13; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.952; 覆盖度=25.12; E 值=5.62e-13; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.204; 覆盖度=103.349; E 值=4.78e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010929 | positive regulation of auxin mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.204; 覆盖度=103.349; E 值=4.78e-55; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0060918 | auxin transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.204; 覆盖度=103.349; E 值=4.78e-55; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080113 | regulation of seed growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.952; 覆盖度=25.12; E 值=5.32e-13; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.204; 覆盖度=103.349; E 值=4.78e-55; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.204; 覆盖度=103.349; E 值=4.78e-55; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G54200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.965; 覆盖度=68.182; E 值=9.01e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G13980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.204; 覆盖度=103.349; E 值=4.78e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G12050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.914; 覆盖度=55.742; E 值=6.35e-07 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0175800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.952; 覆盖度=25.12; E 值=5.62e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |