基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G425900 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:106311449-106313466 (+) |
| 描述 | Similar to CML4: Calmodulin-like protein 4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002715 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g07490 |
潜在的钙感受器。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g12860 |
潜在的钙离子感受器,所需于花粉管对胚珠受精的吸引。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g43290 |
潜在的钙感受器。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0606600 |
潜在的钙感受器。 | 暂无已核实直接文献 |
Os12g0228800 |
潜在的钙感受器。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.323; 覆盖度=65.401; E 值=1.02e-45; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.632; 覆盖度=64.135; E 值=2.77e-44; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005777 | peroxisome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.632; 覆盖度=64.135; E 值=2.77e-44; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=65.823; E 值=1.54e-45; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010008 | endosome membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.323; 覆盖度=65.401; E 值=1.02e-45; UniProt GO evidence=IDA:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0012505 | endomembrane system | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.323; 覆盖度=65.401; E 值=1.02e-45; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005509 | calcium ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.323; 覆盖度=65.401; E 值=1.02e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G05990 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=51.316; 覆盖度=64.135; E 值=2.86e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G43290 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=65.823; E 值=1.54e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G07490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.632; 覆盖度=64.135; E 值=2.77e-44 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G59440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.323; 覆盖度=65.401; E 值=1.02e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0492800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.742; 覆盖度=65.401; E 值=2.97e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |