基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G418400 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:104479393-104481458 (+) |
| 描述 | Similar to OTU5: OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 5 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002828 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g62940 |
水解酶,可在体外去除蛋白质上的结合泛素,因此可能在蛋白质周转水平上通过防止降解发挥重要的调控作用(可能)。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006508 | proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.208; 覆盖度=100.654; E 值=1.03e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008283 | cell population proliferation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.0; 覆盖度=98.039; E 值=6.69e-54; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016579 | protein deubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.284; 覆盖度=99.02; E 值=3.6e-54; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0017148 | negative regulation of translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.0; 覆盖度=98.039; E 值=6.69e-54; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043248 | proteasome assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.0; 覆盖度=98.039; E 值=6.69e-54; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045727 | positive regulation of translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.0; 覆盖度=98.039; E 值=6.69e-54; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0140374 | antiviral innate immune response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.284; 覆盖度=99.02; E 值=3.6e-54; UniProt GO evidence=IMP:ZFIN | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.208; 覆盖度=100.654; E 值=1.03e-129; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.208; 覆盖度=100.654; E 值=1.03e-129; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004843 | cysteine-type deubiquitinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.208; 覆盖度=100.654; E 值=1.03e-129; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G62940 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.208; 覆盖度=100.654; E 值=1.03e-129 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dre:393194 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.284; 覆盖度=99.02; E 值=3.6e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:51633 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.028; 覆盖度=92.81; E 值=9.13e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:72201 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.0; 覆盖度=98.039; E 值=6.69e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | xtr:496720 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.192; 覆盖度=93.791; E 值=4.59e-52 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |