基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G318330 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:79045032-79045822 (-) |
| 描述 | Similar to MBR2: E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_038412 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2XN66 |
可能的纤维素合酶终端复合体(‘花状体’)的催化亚基,参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶,这是细胞壁形成的主要机制。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0808100 |
可能的纤维素合酶终端复合体(‘花状体’)的催化亚基,参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶,这是细胞壁形成的主要机制。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0208500 |
可能的纤维素合酶终端复合体(‘花状体’)的催化亚基,参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶,这是细胞壁形成的主要机制。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009845 | seed germination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010218 | response to far red light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010228 | vegetative to reproductive phase transition of meristem | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75; UniProt GO evidence=IGI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043161 | proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061659 | ubiquitin-like protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G15530 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.622; 覆盖度=42.199; E 值=3.38e-72 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G34040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.876; 覆盖度=45.745; E 值=1.65e-75 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G42940 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.75; 覆盖度=28.369; E 值=3.12e-51 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0667700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.847; 覆盖度=20.922; E 值=1.75e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0648800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.544; 覆盖度=26.064; E 值=3.41e-50 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4326322 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.847; 覆盖度=20.922; E 值=1.75e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |