基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G225500 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:57329699-57335424 (+) |
| 描述 | Similar to HCAR: 7-hydroxymethyl chlorophyll a reductase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_003963 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g04620 |
可能的铁硫类黄素蛋白,利用铁氧还蛋白作为还原当量,将7-羟甲基叶绿素a转化为叶绿素a。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0320100 |
可能的铁硫类黄素蛋白,利用铁氧还蛋白作为还原当量,将7-羟甲基叶绿素a转化为叶绿素a。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0015994 | chlorophyll metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.345; 覆盖度=101.096; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033354 | chlorophyll cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.345; 覆盖度=101.096; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.345; 覆盖度=101.096; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.345; 覆盖度=101.096; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016151 | nickel cation binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.328; 覆盖度=53.509; E 值=1.01e-16; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.345; 覆盖度=101.096; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050454 | coenzyme F420 hydrogenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.328; 覆盖度=53.509; E 值=1.01e-16; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050660 | flavin adenine dinucleotide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.328; 覆盖度=53.509; E 值=1.01e-16; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051536 | iron-sulfur cluster binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.345; 覆盖度=101.096; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0052592 | oxidoreductase activity, acting on CH or CH2 groups, with an iron-sulfur protein as acceptor | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.815; 覆盖度=88.816; E 值=1e-158; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090415 | 7-hydroxymethyl chlorophyll a reductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.345; 覆盖度=101.096; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ana:all1601 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.815; 覆盖度=88.816; E 值=1e-158 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G04620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.345; 覆盖度=101.096; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0320100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=79.814; 覆盖度=94.518; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mba:Mbar_A0449 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=26.339; 覆盖度=49.123; E 值=8.82e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4335472 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=79.814; 覆盖度=94.518; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |