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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA01G183060
当前查询版本TK1151
位置Chr01:46988015-46989127 (+)
描述Similar to PCMP-E13: Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g56310 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_004215 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g56310 含五肽重复蛋白 At5g56310。 暂无已核实直接文献
At1g08070 参与叶绿体中多个位点的RNA编辑事件。 暂无已核实直接文献
At2g22410 含五肽重复序列蛋白At2g22410,线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g47530 含五肽重复序列的蛋白质 At3g47530。 暂无已核实直接文献
At5g40405 推测含五重复肽的蛋白 At5g40405。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.386; 覆盖度=94.249; E 值=5.35e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009451RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.033; 覆盖度=91.28; E 值=5.68e-179; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016554cytidine to uridine editing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.492; 覆盖度=93.506; E 值=2.84e-128; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031425chloroplast RNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.386; 覆盖度=94.249; E 值=5.35e-129; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0080156mitochondrial mRNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.918; 覆盖度=90.167; E 值=7.51e-133; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1900865chloroplast RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.386; 覆盖度=94.249; E 值=5.35e-129; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.033; 覆盖度=91.28; E 值=5.68e-179; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.386; 覆盖度=94.249; E 值=5.35e-129; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.033; 覆盖度=91.28; E 值=5.68e-179; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.492; 覆盖度=93.506; E 值=2.84e-128; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.492; 覆盖度=93.506; E 值=2.84e-128; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G20540KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.918; 覆盖度=90.167; E 值=7.51e-133UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G40405KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=37.984; 覆盖度=95.733; E 值=9.05e-126UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G56310KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.033; 覆盖度=91.28; E 值=5.68e-179UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G59200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.386; 覆盖度=94.249; E 值=5.35e-129UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G66520KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.492; 覆盖度=93.506; E 值=2.84e-128UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release